A data da criação da Freguesia de São Bartolomeu de Pirajá é uma incógnita pela escassez de documentos sobre a localidade no período de estudo. Schwartz (1998) apresenta que foi fundada em 1578 juntamente com a freguesia de Paripe e Purificação. Silva (2000) aponta que a freguesia foi fundada no século XVI, isto é, sem datação precisa, como uma freguesia pertencente ao Recôncavo. Como dito no tópico anterior, a freguesia de São Bartolomeu de Pirajá passa a municipalidade de Salvador em meados do Século XVII.
Muitas pessoas que moram na localidade acreditam que a igreja que se encontra na praça principal logo na entrada do bairro é a primeira igreja construída daquele local. A igreja do engenho público de Pirajá, citada por Gabriel Soares, vai se tornar a primeira igreja matriz da freguesia. Acredita-se que a mesma estava construída as margens do rio que existia na região, que tem seu afluente dentro da região do Parque São Bartolomeu. Como esclarece Schwartz (1998), os engenhos do Recôncavo e suas capelas surgem muito antes do estabelecimento das vilas e paróquias, por isso as igrejas dos primeiros engenhos do Recôncavo se tornaram a matriz da freguesia da localidade. Esta mesma igreja se encontrava em péssimas condições no ano de 1757 e, por conta disso, foi edificada uma nova matriz datada da segunda metade do século XVIII, no local onde está situada a atual Igreja de São Bartolomeu no Bairro de Pirajá. Acredita-se que o primeiro padre a administrar os sacramentos na igreja primitiva foi o Padre Vicente Rodrigues. (MATTOS, 1987)