Com o fracasso de algumas capitanias no Brasil, que inclui a Capitania da Bahia, o império Português decidiu implementar um sistema ao qual pudesse administrar de forma mais próxima a colônia do Brasil, por isso foi instituído o Governo-Geral. a instalação do novo sistema político administrativo do governo-geral ocorreu a partir de 1548, com a compra da capitania da Bahia por parte da coroa, nesta área foi construída a primeira cidade do Brasil - São Salvador - cuja prioridade foi funcionar como sede do governo que estava se constituindo.
O Regimento de Thomé de Souza, primeiro governador, foi assinado no mesmo ano de instituição do governo-geral, e nele está as obrigações e as funções do novo governador. O modelo de governo criado assume um caráter militar, político e administrativo, muito mais que um simples posto de trocas comerciais. A partir desse momento, o processo de colonização vai, paulatinamente, se consolidando.
Ainda sobre o referido regimento, além de estipular itens direcionados à defesa militar e a maneira como os colonos deveriam agir com os grupos indígenas, o documento também estipula como deveria ser a ocupação das terras e a construção da cidade de Salvador. após a chegada e o estabelecimento da cidade e sua administração, deveria-se dar de sesmarias algumas léguas de terra em locais próximos à foz de rios para que os colonos, que tenham condições para tal empreendimento, construam engenhos para o fabrico do açúcar.
Nas localidades do subúrbio de Salvador, a ocupação retoma o curso do período das capitanias hereditárias, porem com outros ocupantes. No caso de Pirajá, as terras deixam de ser de posse do João de Velosa e passa a ser de propriedade de Simão da Gama e Andrade, capitão da segunda armada, que chegou na Bahia no tempo de Tomé de Souza, segundo governador do Brasil, e que solicitou sesmaria na localidade a partir do ano de 1550 (SOUZA, 1879).
SHERWIN, J. K. View of St Salvador, a city of South América. [S.l.: s.n.], [1780]. 1 grav, metal, pb, 19 x 29,2cm em f. 22,6 x 36,5